用于污水處理的碳源有碳源一般包括甲醇、乙酸鈉、面粉、葡萄糖等簡單有機物。

甲醇：廣泛認為乙醇做為外碳源具備運作花費低和淤泥生產量小的優勢。

乙酸鈉：乙酸鈉的優勢取決于它能馬上響應反硝化全過程，能用作水廠運行時的緊急處理。糖類：碳源充足的情況下，以葡萄糖為碳源的最佳碳氮與以甲醇為碳源的情況相比非常高，為 6:1~7:1。淤泥水解上清液：生物轉化 VFA 來自污泥水解反應的上清液，因為水解反應所造成的 VFA 有著很高的反硝化速度，碳源能夠立即由污水處理廠內部出示，在污泥減容的一起還降低了碳源運送層面的難題，因此這是現階段較為有優點的碳源。